Ein Schwerpunkt der Forschung in der AG Medizinische Chemie des FMP Berlin ist die Optimierung der in Screeningkampagnen gefundenen Hitstrukturen in Hinblick auf Aktivität, Selektivität oder Zellgängigkeit. Dies erfordert die umfangreiche Durchführung von organischen Synthesen und nachfolgende Aufreinigung der hergestellten Testverbindungen. Durch Kopplung des analytischen Hochdruckchromatographiemoduls mit einem hochempfindlichen Massenspektrometer kann über 2 Detektionsparameter (UV-Spektrum und Q-TOF-Massenspektrum) die Reinheit der Testverbindung zuverlässig validiert werden und die Struktur der Verbindung überprüft werden. Mit diesen Geräten ist es möglich das Molekulargewicht einer Verbindung bis auf vier Stellen hinter dem Komma genau zu messen und mit den berechneten exakten Molekulargewichten der Verbindung zu vergleichen. Dies liefert den exakten, wissenschaftlichen Nachweis für die Existenz der Verbindung und ist als analytische Methode zur Publikation in wissenschaftlichen Journalen unabdingbar. Der bezuschlagte Bieter besitzt zahlreiche Patente (u. A. auf spezifische Bauteile und Funktionen), die das Alleinstellungsmerkmal bilden.