Beschreibung der Beschaffung
Das Klinikum der Universität München benötigt die Erbringung folgender Dienstleistungen für ca. 2 200 Proben:
1. Ein Profil relativer Konzentrationen aller strukturell benannten kleinen Moleküle, welche sowohl endogene Stoffe als auch Xenobiota und ihre Metabolite inkludieren, extrahiert aus den etwa 2 200 Proben und detektiert durch ihre „Global Metabolomics“-Plattform (Datenformat: Excel file).
2. Eine statistische Analyse der resultierenden Daten, welche typischerweise univariate Signifikanztests umfasst (T-tests, ANOVA, Analyse wiederholter Messungen, etc.).
3. Relative Quantifizierung unbekannter Metabolite mit Metabolon-spezifischen Kennungen, z. B. X-12345, die in den übermittelten Proben identifiziert werden konnten. Nur identifizierte Metabolite werden inkludiert. Metabolon berichtet keine vorläufigen Details über unbekannte Metabolite.
4. Update der Kuration des vorherigen Projekts KLUM-02-20MD, damit dieses unbekannte Metabolite enthält. Unbekannte Metabolite werden auch für den aktuellen Batch aus 2200 Proben berichtet (parallel zu „mData“).
Die Firma Metabolon hat für diesen Auftrag folgende Alleinstellungsmerkmale, sodass nur diese Firma die Dienstleistung durchführen kann:
Schon in der Vergangenheit wurde mit der Firma Metabolon zusammengearbeitet, um umfangreiche Profile zirkulierender Metabolite bei Patienten mit akutem Schlaganfall und Vergleichsgruppen zu messen. Vor dem Start dieser Projekte wurde eine umfangreiche Marktrecherche durchgeführt. Diese Recherche wurde vor dem Start des aktuellen Projekts noch einmal aktualisiert und hat sowohl zuvor als auch aktuell ergeben, dass Metabolon, soweit ersichtlich, das weltweit quantitativ umfangreichste und qualitativ vielfältigste Profil an Metaboliten bietet.
Es ist zwingend notwendig, dass die aktuell geplanten Analysen mit zuvor bereits durchgeführten Analysen vergleichbar und integrierbar sind. Hierbei ist zu beachten, dass sich Unterschiede zwischen Messungen durch unterschiedliche Probenaufbereitung (Reagenzien, Protokoll, Dauer), Messplattform, Durchführung der Messung (Reagenzien, Einstellungen an der Plattform, Dauer) und Auswertung (unterschiedliche Datenbanken, die für den Abgleich der Massenspektrometrie-Profile zur Identifizierung der Metaboliten genutzt werden) ergeben können. Diese Messungen sind so stark äußeren Einflussfaktoren ausgesetzt, dass sich beispielsweise auch für die wiederholte Messung gleicher Proben auf der gleichen Plattform mit dem gleichen Protokoll Abweichungen in den Ergebnissen ergeben können. Um die Abweichungen möglichst gering und damit die vorherigen mit den aktuell geplanten Analysen vergleichbar zu halten, ist es zwingend notwendig, dass die aktuell geplanten Analysen wieder durch Metabolon durchgeführt werden, damit sowohl Probenaufbereitung als auch Messplattform, Durchführung der Messung und Auswertung genau übereinstimmen. Sobald es bei einem dieser Schritte zu Abweichungen kommen würde, besteht die Möglichkeit, dass die Ergebnisse nicht mehr vergleichbar und integrierbar sind und wir damit sämtliche bisher erzielte Ergebnisse nicht mehr verwenden könnten.
5. Die Daten der 2 200 Proben werden verbunden („gemerged“) mit den vorherigen Projekten KLUM-02-20MD und KLUM-01-18ML+. Hierfür werden u. a. residuelle Probenmengen der Projekte KLUM-02-20MD und KLUM-01-18ML+ verwendet.