Zusammenfassung der wichtigsten Alleinstellungsmerkmale des NovaSeq X plus mit on-site DRAGEN v4
a) Das Hochdurchsatzsequenziergerät nutzt die vor allem schnellere Sequenziertechnologie XLEAP-SBS
b) Flexibilität bei der Fließzellbelegung: Die acht verschiedenen Lanes der einzelnen Fließzellen können individuell beladen werden. Dies erlaubt die Aufteilung der Fließzelle für verschiedene Projekte/Fragestellungen und reduziert außerdem den notwendigen DNA-Input pro Probe. So kann eine hohe Diversität der vorgesehenen Proben sequenzieren werden und Proben höchst flexibel nach Dringlichkeit abgearbeitet werden.
c) Geringere Sequenzierkosten: Die Reduzierung der Sequenzierkosten liegt bei ca. 50%, wenn man die Kosten der Sequenzierkits auf die prognostizierte Datenmenge bezieht.
d) Kürzere Bearbeitungszeiten: Proben mit hoher Dringlichkeit z.B. für viele onkologische Fragestellungen und schwerkranke Neugeborene können schneller sequenziert werden, da sich die Laufzeit im Vergleich zum Vorgängermodell um fast die Hälfte verkürzt hat.
e) Geringerer Bedarf an Lager- und Kühlraumfläche, da einige notwendige Sequenzierchemikalien lyophylisiert vorliegen.
f) Optimierte Datenverarbeitungsstruktur: In das neue Gerät NovaSeq X Plus wurden vier Bio-IT-Analyseplattformen (DRAGEN Server) integriert, über die die BCL Konvertierung der Rohdaten in lesbare Sequenzdateien mit Qualitätsinformationen (fastq) läuft. Ebenso können limitierte, standardisierte Auswertungen der Daten darüber erfolgen. Dies lässt Kapazitäten frei werden auf einer separaten on-premise Bio-IT-Plattform, auf der spezifische Workflows individuell angepasst werden können. Mit der neuesten Version (v4 statt v3) wurden Prozesse beschleunigt und eine höhere Genauigkeit erzielt.
Weitere Vorteile für die Universitätsklinik Düsseldorf bei der Beschaffung eines NovaSeq X plus mit on-site DRAGEN v4 von Illumina
• Support und Service von Illumina sind im näheren Umfeld vorhanden.
• Die Kompatibilität zu am UKD existierenden Illumina Sequenziergeräten ist hoch, so dass die Mitarbeiter ausschließlich für die Neuerung dieses Geräts geschult werden müssen, nicht aber grundsätzlich für die Arbeitsweise von Illumina-Geräten und nicht für die eigentliche Probenvorbereitung.
• Nach einer umfassenden Marktanalyse des Auftraggebers hat sich herausgestellt, dass das Unternehmen Illumina GmbH das einzige Unternehmen ist, das ein Gerät anbietet, welches alle o.g. Anforderungen erfüllt.