Beschreibung der Beschaffung
Der Pipettierroboter muss zur Vorbereitung von RNA- und DNA-basierten "Next Generation Sequencing (NGS) libraries" angeschafft werden. Er muss folgende Protokolle durchführen können:
- Vorbereitung von Amplicon libraries (z.B. Illumina 16S/ITS),
- Enrichment libraries (z.B. SureSelectXT) und
- libraries für die Gesamtgenomsequenzierung z.B. mit QIASeq FX.
Es muss möglich sein, mindestens 48 RNA/DNA Proben für eine library vorzubereiten.
Bis auf technisch notwendige Interventionen (z.B. externe Qualitätskontrolle) muss die Probenvorbereitung ohne manuelle Intervention (z.B. Nachstellen von Pipettenspitzen) erfolgen. Die Probenanzahl pro Lauf muss vom Anwender frei wählbar sein (Mindestmenge: 8 Proben), und die Automationslösung muss es dem Anwender ermöglichen, die Methode an definierten sicheren Start/Stop Punkten zu beenden oder zu beginnen/weiterzuführen.
Der Auftrag erfasst ferner:
1. Ausstattung
- Ausreichend große Anzahl an Deckpositionen für Spitzenboxen, Mikrotiterplatten und andere Labware (z.B. Reservoire, Tube-Blocks etc.), um den erforderlichen Durchsatz zu erreichen. Soft- und Hardware müssen das Stapeln von Labware auch mit Deckel unterstützen.
- 96-Kanal Pipettierkopf mit einem Arbeitsvolumen von mindesten 300 µL mit selektiver Spitzenaufnahme (Reihen, Spalten oder einzelne Spitzen).
- Flexibler 8-Kanal Pipettierkopf mit einem Arbeitsvolumen von mindesten 1000 µL und kapazitiver Füllstandsmessung. Flüssigkeitsbasiertes System, welches eine Dekontamination ermöglicht.
- Zwei um 360° rotierbare Greifarme, welche den Zugriff auf sämtliche Deckpositionen und somit eine effiziente Nutzung des Decks ermöglichen.
- Integrierter PCR Thermocycler für 96-Well Platten.
- 96 Positionen für 1,5/2,0 mL Reaktionsgefäße.
- Integrierter Barcode-Reader für das Lesen von Barcodes auf Platten und auf 1,5/2,0 mL Reaktionsgefäßen.
- Aktive Heiz- und Kühlpositionen mit einem Temperaturbereich von 4°C bis 100°C.
- Aktive Heiz- und Kühlpositionen mit Schüttelfunktion bei 4°C bis 70°C.
- Schüttelposition (1800 U/min, 12mm Amplitude) mit aktiver Clampingfunktion für Deepwell Plates, u.a. für die Resuspendierung von Magnetic Beads.
- Aktive Waschstation für den 96-Kanal Pipettierkopf mit separatem Segment für jede Pipettenspitzen, um Cross-Kontamination zu vermeiden.
2. Software
- Die Software muss über ein grafisches Interface verfügen, welches die Auswahl der gewünschten Methode sowie deren einfache Konfiguration (z.B. Probenanzahl) ermöglicht. Außerdem muss die Bestückung des Decks inkl. der benötigten Reagenzienmengen (basierend auf der Probenanzahl von der Software automatisch berechnet) schrittweise angezeigt werden. Die korrekte Deckbestückung kann durch zwei integrierte Kameras und automatischer Bilderkennung verfifiziert werden.
- Zur eigenständigen Programmierung oder Anpassung von Methoden müssen vorprogrammierte Standardbefehle (e.g. Verdünnungsreihen, Plattenreplikation, AMPure Bead Aufreinigung, PCR Set-up, selektive Spitzenaufnahme mit Multikanal-Kopf, etc.) in der etablierten Software verfügbar sein.
3. Gewährleistungsrechte
Gewährleistungsrechte über einen Zeitraum von mindestens 1 Jahr.
4. Implementierung
Der Auftrag erfasst auch die vor-Ort Implementierung (inkl. Probenlauf und Troubleshooting) von drei NGS Methoden (Vorbereitung von Amplicon libraries (z.B. Illumina 16S/ITS), Enrichment libraries (z.B. SureSelectXT) und libraries für die Gesamtgenomsequenzierung z.B. mit QIASeq FX).
5. Einweisung und Schulung
Eine technische Einweisung sowie die Schulung von mindesten vier Anwendern vor-Ort (zur Bedienung des Gerätes) ist vom Auftrag ebenfalls erfasst. Des Weiteren muss mindestens ein weiterführendes Mehrtagestraining beim Anbieter (zur Anpassung und Programmierung von Methoden) optional abrufbar sein. Weitere Schulungen (z.B. zur Optimierung von Pipettiertechniken oder zur Programmierung komplexerer Methoden) müssen optional abrufbar sein.