2024-04-02+00:0010:26:38+00:00not-valrd-ser2024-04-05+02:00-1RES-0001TEN-0001CON-0001LOT-0000TEN-0001noTPA-0001LOT-000024EA014CON-00012024-04-01+02:00Raamovereenkomst softwarepakket Franklin.24CONXXTEN-0001TPA-0001ORG-000325ORG-0001Universitair Medisch Centrum UtrechtHeidelberglaan 100Utrecht3584CXNLD30244197Stefan Renee+31 650124864S.Renee@umcutrecht.nlORG-0002Rechtbank Den HaagDen HaagNLD82946175info0883612012informatiebalie.dhg@rechtspraak.nltruefalsesmeORG-0003Genoox Data Systems LTDHachashmonaim Street 100Tel Aviv66978ISR+972 50 777 6044tom@genoox.com00193806-202466/20242024-04-03Z2.3eforms-sdk-1.73a8cfc1c-3283-4804-8208-ca373254b8e6516281f5-686e-486a-923a-666b12b5c2552024-04-02+00:0010:23:49+00:000132014L0024veatNLDhttps://s2c.mercell.com/buyer/14206ORG-0001neg-wo-calltechnicalDe afdeling Genetica heeft een marktverkenning uitgevoerd en daarbij verschillende leveranciers benaderd. Belangrijke voorwaarde is dat de huidige op WES en gen-panel gebaseerde diagnostiek (en die nu met Allissa Interpret wordt geanalyseerd) door het nieuw aan te schaffen pakket kan worden overgenomen. Daarbij is het ook belangrijk om vooruit te kijken naar de nieuwe ontwikkelingen in de genetische diagnostiek van onze sectie. Het nieuwe softwarepakket moet in staat zijn om ook SNP-array’s en Genoom-sequencing (WGS) met daarbij behorende analyse op grote aantallen patiënten ondersteunen. In de huidige situatie worden in Agilent Interpret bestanden met varianten (VCF-files) geïmporteerd. De software annoteert, filtert de varianten en rapporteert de (geselecteerde) varianten die als een mogelijke genetische diagnose worden beschouwd. We hebben uitgebreid de markt bevraagd en de aangeboden producten van diverse partijen bekeken. Van verschillende softwarepakketten zijn demonstraties geweest. De marktverkenning omvatte programmatuur/software die de annotatie, classificatie, filtering, prioritering en genetische rapportage van deze varianten verzorgd met als doelstelling; selectie en rapportage van die varianten die als (kandidaat) genetische diagnose beschouwd (zouden) kunnen worden. Uit deze marktconsultatie is gebleken dat er geen andere redelijke alternatieven bestaan om te voorzien in de specifieke vraagbehoefte van het UMC Utrecht. Franklin Genoox voldoet als product aan de meeste de gestelde eisen, terwijl de andere softwareproducten relatief veel van de gevraagde functionaliteit niet of slechts ten dele beschikbaar hebben. Alle partijen geven aan dat ontbrekende eisen en/of functionaliteit op de nominatie staan om ingepast te worden. Omdat het onduidelijk was wanneer en in welke vorm ontbrekende functionaliteit zal worden ingebouwd, hebben we dat niet meegenomen in de overwegingen. Een belangrijk aspect van onze huidige WES-flow in Allisa Interpret is data-visualisatie, in het bijzonder CNV-visualisatie (een functionaliteit die wijzelf hebben gebouwd in de IGV-browser), en de manier van filtering waarbij gebruik gemaakt wordt van custom-annotaties in het vcf-bestand. Het nieuw aan te schaffen softwaresysteem moet met deze custom-annotaties/functionaliteit kunnen omgaan en CNVs kunnen visualiseren in IGV. Een ander belangrijk aspect is dat het high-throughput WGS-analyses en interpretatie moet ondersteunen (waarbij WGS gebruikt wordt als een “one-test-fits-most” test). WGS vervangt in dit geval de WES, SNP-array, repeat expansie testen en UPD testen. Franklin Genoox is vooralsnog het enige softwarepakket dat het benoemen en interpreteren van deze typen varianten integreert in één enkele analyse. Onze conclusie is dat Franklin (Genoox) voldoet aan vrijwel alle door ons gestelde eisen, het kan omgaan met custom annotatie velden in vcf-bestanden, voorziet in CNV-visualisatie, SNP-array analyse en ondersteund de “one-test-fits-most” benadering. Bovenstaande leidt tot de conclusie dat de mededinging vanwege technische redenen ontbreekt en uitsluitende rechten moeten worden beschermd. Uit de marktverkenning blijkt dat geen andere leverancier voldoet aan de objectief gestelde eisen aan het product. Uit de marktverkenning blijkt voorts dat er geen redelijk alternatief of substituut bestaat om de vraagbehoefte van het UMC Utrecht te vervullen. 24EA014Vrijwillige transparantie software voor analyseren en interpreteren data voor Next Generation Sequencing De afdeling Genetica is voornemens om tot aanschaf van een door Genoox geleverd softwarepakket "Franklin" over te gaan. Dit ter vervanging van het huidige door Agilent geleverde softwarepakket Allisa Interpret. Dit softwarepakket wordt eind 2024 niet meer ondersteund door Agilent. Er is dus dringende noodzaak om een overstap te maken naar een geschikt alternatief. De software wordt gebruikt voor het analyseren en interpreteren van door Next Generation Sequencing (NGS) verkregen data ten behoeve van patiënten met een mogelijk genetisch defect in hun genoom. Het borgen van de genetische zorgtaken van de afdeling Genetica en hiervoor binnen de sectie ontwikkelde werkwijzen staat hierbij voorop. De opdracht bestaat in totaal uit aanschaf van het product, raamovereenkomst, inclusief gebruikslicenties en onderhoudscontract.supplies48180000Zie documentatieanyw-couNLDLOT-0000no-eu-fundsORG-0002true24EA014Vrijwillige transparantie software voor analyseren en interpreteren data voor Next Generation Sequencing De afdeling Genetica is voornemens om tot aanschaf van een door Genoox geleverd softwarepakket "Franklin" over te gaan. Dit ter vervanging van het huidige door Agilent geleverde softwarepakket Allisa Interpret. Dit softwarepakket wordt eind 2024 niet meer ondersteund door Agilent. Er is dus dringende noodzaak om een overstap te maken naar een geschikt alternatief. De software wordt gebruikt voor het analyseren en interpreteren van door Next Generation Sequencing (NGS) verkregen data ten behoeve van patiënten met een mogelijk genetisch defect in hun genoom. Het borgen van de genetische zorgtaken van de afdeling Genetica en hiervoor binnen de sectie ontwikkelde werkwijzen staat hierbij voorop. De opdracht bestaat in totaal uit aanschaf van het product, raamovereenkomst, inclusief gebruikslicenties en onderhoudscontract.supplies48180000Zie documentatieanyw-couNLD2000-01-01Z