PCR system

PCR system

Avdelningen för Biomaterialvetenskap, Institutionen för Kliniska vetenskaper på Göteborgs universitet är i behov av digital PCR systemet QX200 Droplet Digital PCR med automatiserad Droplet generator AutoDG, C1000 Touch Thermal Cycler med 96- Deep well Reaction module och PX1 PCR Plate Sealer.

Förklaring:

Avdelningen för biomaterialvetenskap vid Göteborgs universitet bedriver forskningsprojekt i syfte att öka förståelsen av de cellulära och molekylära mekanismer som styr interaktioner mellan vävnad och material. Genom denna kunskap kan vävnadsvänliga och hållbara material utvecklas för behandling av skador och sjukdomar där implantat och proteser används. Avdelningens forskningsprojekt är framförallt inriktade på in vivo förhållanden, inbegripande experimentella sk mini-implantat. Pågående forskningsprojekt i olika experimentella in vivo-modeller, finansierade av EU och nationella forskningsfinansiärer, är i behov av detaljerad kunskap om de processer som sker i gränszonen mellan material och vävnad. Denna gränszon är en mycket smal zon där de celler som är adherenta till implantat ytan känner av egenskaper hos materialet och i sin tur kommunicerar med andra celler som är distribuerade längre ut i vävnaden med påverkan i vävnadsregeneration. Antalet adherenta celler alt. mikroorganismer är extremt små på implantat ytorna därför ställs stora krav på känsliga analysmetoder i experimentella modeller och kliniska situationer, där cellernas feno- och genotyp kan analyseras.

Analys av genuttrycket hos dessa celler är en stor och mycket viktig del och utförs i dag på avdelningen med konventionella PCR metoder som bara ger möjlighet till relativa jämförelser mot referensgener alternativt standardkurvor. Det är också en stor utmaning med befintliga isoleringsmetoder, med bl.a. risk även för degradationer, att erhålla tillräckligt stora mängder DNA/RNA från få antal celler/mikroorganismer och känsligheten på avdelningens befintliga PCR analys metoder är därför inte tillräckliga och kräver optimeringar som t.ex. tidskrävande amplifiering av prover med assay valideringar.

Avdelningen är i behov av möjligheten att erhålla mycket känslig och absolut kvantifiering av genuttryck i och mellan experiment, från små mängder av DNA/RNA som erhålls vid isolering från celler alternativt mikroorganismer adherenta på implantat ytor.

På grund av storleken på experimenten med stora provantal (upp till ca 1 000 prov) är vi i behov av ett system som analyserar minst 96 prov/analys tillfälle och har helautomatisk dropp generering för robust precision av fördelning av prov till 20 000 partioner (droppar) i 96 provs plattor och Digital PCR fluorescens läsare för 96 brunns format. Färre analystillfällen minskar variationer mellan analyser inom experiment samt data genereras snabbare. Systemet ska ge möjlighet att validera gruppens tidigare forskningsdata utförda med BioRads konventionella PCR instrument (CFX), ex. syntetisering, amplifiering och qPCR. Sammantaget så uppfyller QX200 AutoDG Droplet Digital PCR System våra behov att kunna kvantifiera nukleinsyror utan standardkurvor på basen av våra extremt små cellantal från gränszonen mellan implantat och vävnad.

Med hänvisning till ovan nämnda forskningsmässiga behov samt tekniska skäl, avser Göteborgs universitet attupphandla QX200 AuotDG Droplet Digital från leverantör Bio-Rad Laboratories AB genomförhandlat förfarande utan föregående annonsering, med hänvisning till 6 kap. 14 § punkt 2 i LOU.

Visma annons: https://opic.com/id/aftvlsvzdn